وقد أثر مفهوم تفسير النص القرٱني الذي تبناه الشيخ على مجمل أفكاره الدينية و السياسية، مما عمق طبيعتها الأصولية و المحافظة، وجعل من الخضر حسين رجل دين محافظ اكثر منه مثقفا متفاعلا مع قضايا عصره من وجهة نظر تتبنى المسائل التي شكلت العناصر الأساسية للمشروع الإصلاحي والنهضوي العربي الحديث